El manglar, los espinares, el bosque tropófilo y los corales son todos ecosistemas tropicales muy ricos en diversidad de fauna y flora.
La Isla de Margarita dentro de su apariencia general de aridez posee una diversidad de Zonas de Vida que es poco común encontrar en las otras islas de Venezuela. El Clima caracterizado por la brisa constante de los Vientos Alisios del noreste, la escasa precipitación y la generosa insolación del astro rey; junto a un abrupto Relieve montañoso que se divisa desde las llanuras circundantes, favorecen esta diversidad en lo que se puede considerar un ambiente hostil. Para proteger la fragilidad de estas áreas naturales del invasor crecimiento del hombre, se han creado dos parques nacionales, tres monumentos naturales y la protección especial de toda la costa incluyendo cabos, puntas y lagunas de todas las islas.
El Parque Nacional Cerro Copey preserva las únicas fuentes de agua de la isla al igual que los ecosistemas de bosque. El Parque Nacional La Restinga, con sus grandes lagunas y llanuras costeras bordeadas por los bosques de manglar son criaderos naturales de muchos peces comerciales de mar abierto. El Monumento Natural Las Marites, presenta características similares aunque no iguales a La Restinga, al igual que el Monumento Natural Las Tetas de María Guevara con sus dos pequeñas lagunas costeras y los dos pequeños cerros muy alusivos, hito y encanto de los pescadores desde alta mar. En la zona oriental de la Isla deMargarita el Monumento Natural Matasiete y Guayamurí es una reserva natural e histórica de Nueva Esparta.